北京市基督教三自爱国运动委员会（The Beijing Committee of Three-self Patriotic Movement of the Protestant Church）和北京市基督教教务委员会（Beijing Christian Council）简称北京市基督教“两会”。
1950年，以吴耀宗先生为首的一批有远见的中国基督教前辈发表了《中国基督教在新中国建设中努力的途径》（简称《三自宣言》），提出以“自治、自养、自传”为原则的三自革新运动，迅速得到全国众多基督徒的积极响应。1954年，北京市基督教三自爱国运动委员会成立。其宗旨是：团结北京市基督徒爱国爱教、荣神益人；遵守宪法、法律、法规，贯彻国家政策，弘扬社会道德风尚；坚持教会的独立自主；增强教内外团结，为办好北京市基督教会提供服务，使基督教与社会主义社会相适应，为构建社会主义和谐社会发挥积极作用。
1979年春，经历了“文革”之后的中国教会重新恢复礼拜。1981年，北京市基督教教务委员会成立。其宗旨是：坚持自治、自养、自传，独立自主、自办教会的原则，团结和带领全市所有信奉上帝、承认耶稣基督为主的基督徒，走爱国爱教、荣神益人的道路；在圣灵的引领下，同心合意，遵照圣经真理，制定和完善北京市基督教会规章制度，办好教会；引导全市基督徒为构建社会主义和谐社会发挥积极作用，使北京市基督教与社会主义社会相适应。
在圣灵的感动下，北京市基督教各项事工得到蓬勃开展。目前，北京市已开放的堂点共21座；每年受洗人数超过5000人，全市已接受圣洗礼的信徒达5万余人；圣经发行量约5万本；共有教牧人员123人，其中牧师69位、副牧师17位、专职传道员37位。
北京市基督教“两会”每五年举行一次大会，负责审议《两会工作报告》并选举北京市基督教三自爱国运动委员会新一届主席、副主席、秘书长，选举北京市基督教教务委员会的会长、副会长、总干事。北京市基督教“两会”联合办公，本届“两会”机构下设办公室、外事办公室、网络办公室、房产办公室和财务办公室五个职能部门。
北京市基督教“两会”致力服务和建设北京教会，带领北京市基督徒在至圣的真道上健康成长，鼓励北京基督徒在社会经济和道德建设中做出自己的贡献，并且愿与海内外尊重我国“三自”原则的教会和组织在互相尊重平等友好的基础上建立和发展友谊，共同为基督作出美好的见证。
北京市基督教“两会”的会址设于北京市东城区东单北大街21号，该址为原中华圣经会旧址，始建于1928年，1984年5月被定为北京市文保建筑。
